
赤馬漁港屬第三類漁港, 位於澎湖縣西嶼鄉赤馬村, 於民國56 年首由澎湖縣政府補助工程材料, 並由天主教會補助物質,發動居民以義務勞動方式,修築砌石碼頭 64 公尺。因位於馬公本島及西嶼間內海水面、北面有高地阻擋東北季風,僅東南向稍受颱風之影響,地形隱蔽,颱風時西嶼鄉漁船大部分駛往本港避風,由於原有拋石防波堤兼碼頭設施簡陋,乃於第一期漁港建設方案中改善及擴建,計完成拋石擋土堤 380 公尺,拋石防波堤 125 公尺,北碼頭 225 公尺, 擋土堤 414 公尺, 開闢泊地面積 4.3 公頃(-3.0m),至此本港規模粗具。
來往停泊漁船多達 200 艘,嗣經澎湖縣政府規劃本港為西嶼鄉之中心漁港,惟因部分泊地尚未浚深,且拋石防波堤尚需加強以遮蔽東南向波浪,以保障颱風時漁船停泊安全,「第二期台灣地區漁港建設方案」中撥款 10,100 萬元,完成碼頭約 790 公尺、泊地約 1.66 公頃, 可加強保障颱風時漁船停泊安全,並便利西嶼鄉漁船補給作業。
本港雖為西嶼鄉之中心漁港,目前冷凍、加冰、加油等陸上漁業設施仍有不足,需經馬公運補。「第三期台灣地區漁港建設方案」中計畫延長防砂堤及疏浚泊地,整修現有設施,並增建漁具倉庫、漁民活動中心、加油設備等陸上漁業設施,使本港功能更加完善。本港平時間或有內垵漁船來靠泊,目前港口略受淤砂影響。 主要漁撈方式有流刺網、焚寄網等,漁產經馬公運銷。附近有牛心灣之名勝,屬舊時澎湖八景之一。